轮叶黑藻属于多年生沉水草本，茎直立细长，长50-80厘米，叶带状披针形。酸性环境会抑制黑藻的生长，能耐高水温。质中弱吸附态磷、可还原性磷(RSP)是黑藻利用的主要磷形态，土壤与沉积物相比不利于黑藻生长，营养水平高的河流沉积物有利于黑藻初期生长。黑藻能促进底质中磷向可利用态转化。